迈杰转化医学
欢迎来到迈杰转化医学官网!

迈杰转化医学

迈杰转化医学

服务热线400-007-1121服务热线

多组学综合转化医学全平台

ChIP-Seq分析

ChIP-Seq分析介绍

  • 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,基于Illumina Hiseq测序平台,在全基因组范围内研究组蛋白修饰或被转录因子结合的DNA区域,以高效率的测序手段得到高通量的数据结果。

更多项目敬请咨询 400-007-1121

分析内容

分析内容
原始数据整理、过滤及质量评估
参考基因组注释整理与统计
与参考基因组比对
Peak Calling
Peak相关基因GO注释
Peak相关基因KEGG注释
样品间差异Peak分析
差异Peak相关基因GO富集分析
差异Peak相关基因KEGG通路富集分析
Motif分析

案例解析

小鼠外胚层干细胞中转录因子的相关研究

通过高效的ChIP分析程序,研究了小鼠外胚层干细胞中五种主要的转座因子(ZIC2、OTX2、SOX2、POU5F1和POU3F1)的染色体区域,它们有参与EpiSC维护和体细胞发展过程。

图片10
ChIP里峰的overlap统计

【相关推荐】

央视《匠心》栏目视角看迈杰转化医学